Народився у місті Ташкент, Узбекистан. Закінчив уже у Криму середню школу смт Зуя. З 1998 по 2000 рік навчався у духовній семінарії, а потім три роки в Університеті Аль-Джинан у Лівані на факультеті арабської мови та літератури.

‍

Джеппаров працював сервісним інженером та монтажником на різних малих та великих приватних об'єктах. Крім того, він займався правозахисною діяльністю. Аж до арешту відвідував суди над політв'язнями мусульманами Криму. Організовував навчання дітей та дорослих основ читання Корану. Постійно брав участь у будівництві та тепловому оснащенні мечетей. Займався організацією та відеозйомкою релігійних свят.

У 2015 році двоє співробітників поліції вдерлися в будинок Джеппарова, в якому знаходилися тільки дружина та їхні малолітні діти. За рік до арешту за ним було встановлено постійне стеження. Джеппарова було заарештовано 10 червня 2019 року в місті Білогірськ, у селищі Зуя Білогірського району після того, як у будинках трьох інших кримських татар пройшли обшуки з подальшим затриманням.

12 січня 2021 року Південний окружний військовий суду Росії засудив Айдера Джаппарова до 15 років позбавлення волі.

«В Айдера в ростовському СІЗО загострилися проблеми із серцем, він багато нервував через абсурдність слідства, відхилення аргументів захисту на суді. Це виводить розсудливу людину з нормального стану. Бувало, перед тим, як вивезти на засідання суду, чоловік мав прискорене серцебиття і підвищений артеріальний тиск, він не міг стати на ноги. Після арешту у чоловіка виявили хронічне запалення шкіри — нейродерміт», — дружина Айдера, Маргарита.

‍

‍