Народився в місті Ангрен Ташкентської області, що в Узбекистані. Вступив до технікуму, де здобув професію викладача фізичної культури.
‍

У 1999 році, коли в Бахчисараї відкрилася кримськотатарська школа, він став викладати в ній фізкультуру. Там Сервер пропрацював 7 років, паралельно займаючись вирощуванням зелені й овочевих культур. Пізніше родина почала розводити троянди й гвоздики. У такий спосіб чоловік налагодив свій квітковий бізнес.

У 2002 році в Сервера народилася друга дочка, у якої був вроджений вивих стегна. Донька перенесла серйозну операцію, і він сам доглядав за дитиною з інвалідністю. Купав, возив у лікарні тощо. Загалом у Сервера 13 неповнолітніх дітей. Остання дитина народилася вже після його арешту, який припав на 11 жовтня 2017 року.

12 жовтня 2017 року співробітниками Федеральної служби безпеки РФ були затримані та згодом заарештовані Тимур Ібрагімов, Марлен (Сулейман) Асанов, Мемет Бєлялов, Сейран Салієв, Сервер Зекір'яєв та Ернес Аметов. Усі вони учасники організації «Кримська солідарність» — об'єднання адвокатів, родичів політв'язнів та активістів, яке допомагає кримчанам, які зазнали переслідувань з політичних чи релігійних мотивів.

Сервера Зекір’яєва засудили до 13 років колонії суворого режиму.

В останньому слові на суді Сервер говорив про природу влади царської Росії та СРСР, дивуючись, як РФ робить з кримських татар «терористів» , «радикалів» та «нетрадиційних ісламістів». За його словами, Росія створила всі умови, щоб кримські татари покидали свою батьківщину